肌腱囊腫如果不積極的治療，會導致局部產生壓迫癥狀，對肌腱的功能產生影響，造成疼痛和功能障礙。如果不治療，嚴重時會造成囊腫壓迫骨質，導致骨質的破壞和骨變形，影響局部功能。

肌腱囊腫大部分情況下不會引起明顯的癥狀。如果比較小或者沒有明顯癥狀的時候，不需要特殊的治療，繼續觀察就可以了，但是避免局部反復的受到摩擦以及擠壓。肌腱囊腫如果不治療的話，有可能局部沒有明顯的變化，也有可能會隨著手指手腕的過度活動逐漸增大。增大比較嚴重的情況下，就會引起局部的疼痛感覺，也有可能會壓迫神經出現相應的癥狀。