甲亢需檢查甲狀腺功能包括T3、T4、游離T3T4、促甲狀腺激素以及肝功能和血常規等，來判斷用藥的劑量以及藥物種類是否合適繼續治療。如果肝功能和血常規異常，需考慮停藥，更換放射碘治療。

檢查甲狀腺功能每個醫院檢查的項目一般是沒有太大的差異的，不過不同的患者因為不同的癥狀，檢查的項目就會出現一些差別，按照常規來說，只需要檢查甲狀腺的三項功能就夠了，不過對于一些有特殊病癥的患者，比如說患有甲狀腺結或者是甲狀腺突眼這類，就需要再檢查一下甲狀腺彩超了，有的患者可能還要檢查甲狀腺抗體。