亞臨床甲狀腺功能減退的患者應避免吃高蛋白、高脂肪、高膽固醇的食物，比如豬肝、鴨心、鴨肝、蛋糕、奶油、炸雞、肥肉等等。還需避免吃腌制類食物，比如咸菜、腌蘿卜、辣白菜、咸鴨蛋等等。

亞臨床甲狀腺功能減退的患者，如果甲狀腺球蛋白抗體、甲狀腺過氧化物抗體水平明顯升高，患者不能吃含碘含量比較高的食物，像海帶、紫菜。因為國內、外研究發現，如果碘攝入量過度增加后，會加重抗體或者免疫炎癥反應對甲狀腺濾泡細胞的損傷，可能導致患者從亞臨床甲狀腺功能減退進展成為真正的臨床甲狀腺功能減退，需要終身服用藥物治療。除了碘含量比較高的食物以外，其他食物對亞臨床甲狀腺功能減退患者來說都可以吃，沒有需要特別注意的。