夫妻染色體檢查的費用是不固定的，主要取決于醫院的收費標準以及檢查項目的多少。正常情況下，普通的夫妻染色體檢查需要的費用在1000~1200元左右。如果做進一步詳細的染色體檢查，如染色體核型分析等，夫妻雙方都檢查需要的費用大概在3000元到5000元左右。

染色體檢查主要用于：1、排除有無遺傳性疾病或懷疑有遺傳疾??；2、男性重度少精子癥和無精子癥；3、有不良孕產史，如死胎、畸形、復發性流產等。男方檢查染色體核型分析大約350元，Y染色體微缺失（無精子基因）大約1350元。女方染色體核型分析350元，如果做流產組織染色體非整倍體核型分析大約2100元。