人類基因組計劃(英語：Human Genome Project, HGP)是一項規模宏大，跨國跨學科的科學探索工程。其宗旨在于測定組成人類染色體(指單倍體)中所包含的30億個堿基對組成的核苷酸序列，從而繪制人類基因組圖譜，并且辨識其載有的基因及其序列，達到破譯人類遺傳信息的終目的。基因組計劃是人類為了探索自身的奧秘所邁出的重要一步，是繼曼哈頓計劃和阿波羅登月計劃之后，人類科學史上的又一個偉大工程。

　　截止到2005年，人類基因組計劃的測序工作已經完成。其中，2001年人類基因組工作草圖的發表(由公共基金資助的國際人類基因組計劃和私人企業塞雷拉基因組公司各自獨立完成，并分別公開發表)被認為是人類基因組計劃成功的里程碑。

　　研究內容編輯HGP的主要任務是人類的DNA測序，包括下圖所示的四張譜圖，此外還有測序技術、人類基因組序列變異、功能基因組技術、比較基因組學、社會、法律、倫理研究、生物信息學和計算生物學、教育培訓等目的。

　　遺傳圖譜

　　又稱連鎖圖譜(linkage map)，它是以具有遺傳多態性(在一個遺傳位點上具有一個以上的等位基因，在群體中的出現頻率皆高于1%)的遺傳標記為“路標”，以遺傳學距離(在減數分裂事件中兩個位點之間進行交換、重組的百分率，1%的重組率稱為1cM)為圖距的基因組圖。遺傳圖譜的建立為基因識別和完成基因定位創造了條件。意義：6000多個遺傳標記已經能夠把人的基因組分成6000多個區域，使得連鎖分析法可以找到某一致病的或表現型的基因與某一標記鄰近(緊密連鎖)的證據，這樣可把這一基因定位于這一已知區域，再對基因進行分離和研究。對于疾病而言，找基因和分析基因是個關鍵。

　　第1代標記

　　經典的遺傳標記，例如ABO血型位點標記，HLA位點標記。70年中后期，限制性片段長度多態性(RFLP)，位點數目大與105，用限制性內切酶特異性切割DNA鏈，由于DNA的一個“點”上的變異所造成的能切與不能切兩種狀況，可產生不同長度的片段(等位片段)，可用凝膠電泳顯示多態性，從片段多態性的信息與疾病表型間的關系進行連鎖分析，找到致病基因。如Huntington癥。但每次酶切2-3個片段，信息量有限。

　　第2代標記

　　1985年，小衛星中心(minisatellite core)、可變串聯重復VNTR(variable number of tandem repeats)可提供不同長度的片段，其重復單位長度為6至12個核苷酸 ，1989年微衛星標記(microsatellite marker)系統被發現和建立，重復單位長度為2~6個核苷酸，又稱簡短串聯重復(STR)。

　　第3代標記

　　1996年MIT的Lander ES又提出了SNP(single nucleotide polymorphysm)的遺傳標記系統。對每一核苷酸突變率為10-9，雙等位型標記，在人類基因組中可達到300萬個，平均約每1250個堿基對就會有一個。3~4個相鄰的標記構成的單倍型(haplotype)就可有8~16種。